
Blastx将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与蛋白质数据库中的序列进行比对,对分析新序列和EST很有用。 A. 正确 B. 错误
Blastx是NCBI开发的序列比对工具,它的核心功能是将输入的核酸序列(DNA或RNA)按照所有六种可能的阅读框架翻译成蛋白质序列,再与蛋白质数据库进行比对。这种设计使其特别适合处理新发现的序列或EST(表达序列标签),因为即使核酸序列不完整或含有测序错误,blastx仍能通过翻译后的蛋白质序列找到同源匹配。答案:A. 正确
这种“先翻译后比对”的策略,比直接进行核酸比对(如BLASTn)更能发现进化上保守的蛋白质编码区域,尤其在密码子简并性导致核酸序列差异较大但蛋白质序列仍相似的情况下。对于EST这类通常来自mRNA的短序列,blastx能有效识别其编码的蛋白质功能域,是功能基因组学研究中的常用工具。