十八届三中全会明确提出要建立（）。 A、国家安全局 B、国家安全委员会 C、全面深化改革领导小组 D、全面深化改革领导委员会 E、国家食品药品监督管理总局

正确答案是 B、国家安全委员会和 C、全面深化改革领导小组。

解析如下：

中国共产党第十八届中央委员会第三次全体会议（简称“十八届三中全会”）于2013年11月召开，会议通过了《中共中央关于全面深化改革若干重大问题的决定》。这次会议在机构设置上做出了两项重大决定：

设立国家安全委员会（选项B）

目的：目的是完善国家安全体制和国家安全战略，确保国家安全。作为一个高层级的决策和议事协调机构，它负责统筹协调涉及国家安全的重大事项和重要工作。

设立中央全面深化改革领导小组（选项C）

目的：负责全面深化改革的总体设计、统筹协调、整体推进、督促落实。该小组在中央政治局及其常委会领导下工作，是领导中国新一轮改革的最高指挥部。

其他选项分析：

A、国家安全局：这是一个早已存在的机构，并非十八届三中全会新设立。

D、全面深化改革领导委员会：名称不准确，正确的名称是“领导小组”。

E、国家食品药品监督管理总局：该机构已于2013年3月的国务院机构改革中组建，并非十八届三中全会提出建立。

因此，本题的明确答案是 B和C。