世代交替是指原虫生活史中的（）. A. 自生生活和寄生生活的交替 B. 两种宿主之间的转换 C. 有性生殖与无性生殖的交替 D. 裂体增殖与配子生殖交替 E. 发育时期不同，但宿主一样

正确答案是 C. 有性生殖与无性生殖的交替。

解析：
在寄生虫学（尤其是原虫生活史）中，“世代交替”通常指 有性生殖与无性生殖交替进行 的生殖方式。例如，疟原虫在人体内进行无性裂体增殖，在蚊体内进行有性生殖（配子生殖），两者交替完成生活史。

其他选项分析：

A. 自生生活和寄生生活的交替：有些原虫有自生生活阶段，但这不是“世代交替”的定义。

B. 两种宿主之间的转换：属于宿主转换，与生殖方式无关。

D. 裂体增殖与配子生殖交替：是世代交替的一种具体形式，但选项 C 更符合教材一般定义。

E. 发育时期不同，但宿主一样：属于发育阶段变化，不涉及生殖方式的交替。

因此，根据医学寄生虫学常见定义，应选 C。