从自然科学层面上来讲生态科学主要涵盖？（）A.地理生态学 B.环境生态学 C.微生物生态学 D.生态工程学

从自然科学层面，生态学涵盖多个分支学科，其中微生物生态学（C） 和环境生态学（B） 是明确的自然科学分支。地理生态学（A）可视为生态学与地理学的交叉领域，而生态工程学（D）更偏向应用技术学科。

具体分析：

微生物生态学（C）
作为生态学的核心分支之一，它研究微生物群落与环境的相互作用，属于自然科学范畴。例如，基金项目分类中明确将其归为“农业及微生物组”分支，其研究对象包括细菌、真菌等微生物在生态系统中的功能与演化。

环境生态学（B）
聚焦生物与环境污染物、气候变化等因素的关系，属于自然科学中的环境科学与生态学交叉领域。研究内容包括水域生态、环境生物等方向，被列为基金资助的“环境组”分支，并以自然系统的物质循环为核心。

地理生态学（A）
虽未在文献中作为独立分支明确列出，但其研究内容（如地理单元差异对生态系统的影响）可视为生态学与地理学的交叉领域。例如，陆地生态学、水生生态学等分支均涉及地理环境因素，但本身并非自然科学层面的独立核心分支。

生态工程学（D）
属于应用技术学科，强调通过工程手段解决生态问题，如污染防治、资源利用等。其本质是将生态学原理应用于实践，而非纯粹的自然科学理论研究。

结论

正确答案为 B（环境生态学）和 C（微生物生态学）。二者均以自然科学理论为基础，研究生物与环境的自然规律；而地理生态学偏向交叉学科，生态工程学则属于应用技术领域。

生态学的分支划分常基于研究对象（如生物类群、环境类型）或尺度（如分子、全球），未来随着学科交叉，其边界可能进一步拓展，但自然科学的核心仍围绕生物与环境的相互作用机制展开。